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DNA_RNA提取、纯化

一、DNA/RNA提取、纯化

从检测样本中提取基因组DNA和总RNA后,在经过核酸提纯,能够去除混杂的蛋白质、多糖和各种大小分子核酸同类物。博艾迈迪森生物可以提供从不同的材料样本中提取基因组DNA和总RNA,及纯化技术服务。

核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作 。


问题一:DNA样品不纯,抑制后续酶解和PCR反应。

DNA中含有蛋白、多糖、多酚类杂质

重新纯化DNA,去除蛋白、多糖、多酚等杂质

DNA在溶解前,有酒精残留,酒精抑制后续酶解反应

重新沉淀DNA,让酒精充分挥发

DNA中残留有金属离子

增加70%乙醇洗涤的次数(2-3次)

 

问题二:DNA降解。

材料不新鲜或反复冻融

尽量取新鲜材料,低温保存材料避免反复冻融

未很好抑制内源核酸酶的活性

液氮研磨或匀浆组织后,应在解冻前加入裂解缓冲液

提取过程操作过于剧烈,DNA被机械打断

在提取内源核酸酶含量丰富的材料的DNA时,可增加裂解液中螯合剂的含量

外源核酸酶污染

细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔

反复冻融

所有试剂用无菌水配制,耗材经高温灭菌

将DNA分装保存于缓冲液中,避免反复冻融

 

问题三:DNA提取量少

实验材料不佳或量少

尽量选用新鲜(幼嫩)的材料

破壁或裂解不充分

动植物要匀浆研磨充分;G+菌、酵母裂解前先用生物酶或机械方式破壁

沉淀不完全

高温裂解时,时间适当延长(对于动物细胞、细菌可增加PK的用量)

洗涤时DNA丢失

加辅助物,促进沉淀

洗涤时,最好用枪头将洗涤液吸出,勿倾倒

低温沉淀,延长沉淀时间


二、影响RNA提取的因素

1、材料

新鲜,切忌使用反复冻融的材料,如若材料来源困难,且实验需要一定的时间间隔。可以先将材料贮存在TRIzol或样品贮存液中,于-80℃或-20℃保存。如要多次提取,请分成多份保存,液氮长期保存,-20℃短期保存。


2、样品破碎及裂解

根据不同材料选择不同的处理方法:

1 培养细胞:通常可直接加裂解液裂解。

2 酵母和细菌:一般TRIzol可直接裂解,对于一些特殊的材料可先用酶或者机械方法破壁。

3 动植物组织:先液氮研磨和匀浆,后加裂解液裂解。期间动作快速,样品保持冷冻,样品量适当,保证充分裂解,为减少DNA污染,可适当加大裂解液的用量。


3、纯化

在使用氯仿抽提纯化时,一定要充分混匀,且动作快速。

经典的纯化方法,如 LiCl 沉淀等,虽然经济,但操作时间长,易造成 RNA 降解。

柱离心式纯化方法:抽提速度快,能有效去除影响 RNA 后续酶反应的杂质,是目前较为理想的选择




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